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文檔簡介
1、目的:
探究pri-miR-218基因rs11134527多態(tài)性與中國東北地區(qū)人群肺癌易感性,對(duì)符合條件的NSCLC患者行放療劑量達(dá)40Gy/20f時(shí)腫瘤退縮率之間關(guān)系的分析,為提高肺癌放射敏感性尋求新的研究思路。
方法:
按照病例對(duì)照研究方法的原則,病例組中符合條件者納入放射敏感性分析。研究對(duì)象為東北地區(qū)漢族人群,研究個(gè)體之間無血緣關(guān)系。經(jīng)研究者知情同意后,采集外周血,同時(shí)完成流行病學(xué)資料調(diào)查。病例組54
2、3例,均為有明確病理結(jié)果的原發(fā)性肺癌患者,來自中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院、中國醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院。具體的統(tǒng)計(jì)結(jié)果為:鱗狀細(xì)胞癌239例、腺癌210例、小細(xì)胞癌94例。對(duì)照組531例是來自沈陽軍區(qū)總醫(yī)院體檢的健康人群。所有標(biāo)本于2009年9月至2015年5月收集。共納入符合條件行放射敏感性分析的患者136例(鱗狀細(xì)胞癌87例、腺癌49例):①穿刺或細(xì)胞學(xué)病理診斷為NSCLC;②3D-CRT可測得放療前以及放療至40Gy/20f時(shí)的腫瘤體積
3、;③放射治療無中斷;④未行手術(shù)治療者;⑤放療前均行2周期化療,放療期間未行同步化療。均采用Siemens直線加速器的6MV-X線行3D-CRT體外照射。單次劑量為2Gy,達(dá)到40Gy后重新掃描CT。兩次CT掃描病人的擺位條件、參考中心相同。在計(jì)劃系統(tǒng)中進(jìn)行兩次掃描CT的配準(zhǔn),參考配準(zhǔn)圖像進(jìn)行腫瘤靶區(qū)的勾畫。首次勾畫的腫瘤大體體積定義為GTV。重新勾畫的腫瘤大體體積命名為GTVs。TRR=(GTV-GTVs)/GTV×100%。
4、 以酚-氯仿法提取所采集標(biāo)本的DNA,Taqman real-time PCR方法和SDS(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)軟件程序進(jìn)行基因分型。實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)量控制為在每個(gè)96孔檢測單元分別設(shè)立陰性對(duì)照和重復(fù)標(biāo)本。每個(gè)SNP的信號(hào)強(qiáng)度應(yīng)在兩個(gè)尺度上形成三個(gè)明顯的簇,且有顏色信號(hào)讀出。PCR反應(yīng)體系如下:2X Taqman Master Mix2.5μl,20X引物與探針混合物0.125μi,H2O1.375μl,DNA1.00μl。PCR擴(kuò)增條件:
5、首先95℃預(yù)變性10分鐘,然后92℃變性30秒,最后60℃退火和延伸1分鐘,總共47個(gè)循環(huán)。以SDS軟件Allelic Discrimination程序進(jìn)行終點(diǎn)分析,判斷樣本的基因分型結(jié)果。
數(shù)據(jù)整理分析應(yīng)用SPSS17.0軟件,以p<0.05認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。應(yīng)用x2檢驗(yàn)比較相關(guān)危險(xiǎn)因素的暴露、人口學(xué)特征、對(duì)照組中的HWE分布情況以及SNP基因型在病例與對(duì)照組二者之間的分布差異;以多因素logistic回歸計(jì)算比值比(odd
6、s ratio,OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。采用t檢驗(yàn)比較腫瘤退縮率與性別、年齡、吸煙情況及腫瘤大小之間的關(guān)系,用方差分析比較腫瘤退縮率與分期及基兇多態(tài)性之間的關(guān)系。
結(jié)果:
對(duì)照組的基因型分布頻率經(jīng)x2檢驗(yàn),符合HWE(p=0.231,x2=1.436)。調(diào)整年齡、性別和吸煙狀態(tài)后,得出攜帶rs11134527位點(diǎn)G/G基因型和A/A基因型的患者與肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性(p
7、=0.134,OR=0.699)。按病理類型分層分析,得出無論是在鱗癌、腺癌還是小細(xì)胞癌與對(duì)照組基因型相比均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。Pri-miR-218 rs11134527的基因型A/A、A/G、G/G在136例可計(jì)算腫瘤退縮率患者中的分布頻率分別是39.0%、47.8%、13.2%。攜帶A/A基因型的患者腫瘤退縮率明顯高于A/G和G/G基因型(p=0.011),合并A/G和G/G基因型后比較,差異更加明顯(p=0.004)。同時(shí)發(fā)現(xiàn),吸煙組
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