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文檔簡介
1、基因組測序表明正常實驗室培養(yǎng)條件下,真菌基因組很多次級代謝產物合成的基因簇是沉默表達的。共培養(yǎng)是激活沉默基因挖掘新穎次級代謝產物的策略之一。本研究中,15種木腐真菌和2種草腐真菌首先用于構建共培養(yǎng)體系,在所有的136組共培養(yǎng)組合中,云芝(Trametes versicolor)和樹舌靈芝(Ganoderma applanatum)共培養(yǎng)的抑制區(qū)有明顯的拮抗線和顏色變化,因此被選擇作為共培養(yǎng)模型。數據驅動代謝組分析發(fā)現有62個差異化合物,
2、包括共培養(yǎng)后新合成和共培養(yǎng)后含量明顯增加的化合物。分子網絡(molecular network analysis)對這些誘導的差異化合物二級質譜圖進行分析,發(fā)現一個包含木糖苷化合物及其相應的糖苷配體的次級網絡。借助核磁共振譜(NMR)和氣相色譜-質譜(GC-MS),對這個次級網絡中化合物2和3進行了結構解析,通過驗證發(fā)現這兩個化合物均是由樹舌靈芝刺激下的云芝產生的。借助生物信息學方法對云芝整個基因組序列進行比對分析,成功預測出6個可能的
3、編碼木糖基轉移酶以實現木糖基化的基因,其中基因 XP_008043378.1是最可能的備選基因。此外,細胞活性實驗表明,化合物2在低濃度時具有提高呼吸道上皮細胞Beas-2B的細胞活性的潛力。同時,在樹舌靈芝中首次檢測到苯乳酸和苔色酸(化合物1和5),驗證其可能來自于對云芝壓力的防御。目前,我們成功的建立了一個激活沉默基因表達以獲得新穎化合物的有價值共培養(yǎng)平臺。這個平臺將在繼續(xù)開發(fā)其他新穎化合物中起著重要作用。此研究也將提供解析在真菌防
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