青島文昌魚早期發(fā)育相關(guān)基因HMGB、Thymosinβ-4、RACK1和文昌魚系統(tǒng)進(jìn)化的研究.pdf

1、　　文昌魚(Amphioxus)是一種頭索動(dòng)物,在分類地位上,它被認(rèn)為是現(xiàn)存最接近于脊椎動(dòng)物的無脊椎動(dòng)物,一向被認(rèn)為是脊椎動(dòng)物的祖先而倍受生物學(xué)家的重視,它的身體構(gòu)造與脊椎動(dòng)物相似只是更加簡(jiǎn)單,是研究動(dòng)物進(jìn)化和動(dòng)物胚胎發(fā)育的典型材料。本工作首次克隆了文昌魚發(fā)育相關(guān)基因HMGB,thymosin-β4和RACKI基因的全長(zhǎng)cDNA,并研究了它們?cè)趍RNA水平的發(fā)育表達(dá)圖式及其系統(tǒng)進(jìn)化,此外還通過文昌魚線粒體4個(gè)蛋白基因的克隆對(duì)文昌魚的分子

2、系統(tǒng)進(jìn)化進(jìn)行了研究。本文的一系列原創(chuàng)性研究成果為揭示文昌魚的發(fā)育機(jī)制和闡明脊椎動(dòng)物的進(jìn)化提供了重要資料。
　　我們從cDNA文庫中得到一段全長(zhǎng)833bp的cDNA,編碼一段222個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì),和其他物種HMGB有著很高的同源性。該基因演繹的蛋白和海膽,七鰓鰻,紅鱒,爪蟾,雞,鼠和人的HMGB蛋白有從41到50%的同源性,我們?yōu)樵摶蛎麨锳mphiHMGB(GenBank accession number： AY57870

3、9)。AmphiHMGB演繹的蛋白含有4個(gè)保守的HMGB結(jié)構(gòu)域：HMG-box A,HMG-box B,中間的連接序列和C端的酸性尾巴。選取16個(gè)脊椎動(dòng)物和無脊椎動(dòng)物的同源基因用鄰近相連法進(jìn)行建樹。結(jié)果分析顯示AmphiHMGB從脊椎動(dòng)物的底部分出,自成一枝。這說明HMGB基因至少是在文昌魚以后開始基因倍增的,在文昌魚及其他無脊椎動(dòng)物里僅有1個(gè)HMGB基因。Southern雜交結(jié)果也顯示在青島文昌魚基因組中只存在1個(gè)HMGB的拷貝。原位