水稻AGO基因家族的生物信息學分析.pdf

1、Argonautes(AGOs)是生物有機體中普遍存在的一類比較保守的蛋白，并且在不同物種的RNAi及相關的途徑中具有十分重要的功能，也調控模式植物擬南芥的生長發(fā)育過程。水稻作為單子葉模式植物和重要的糧食作物，其基因組中AGO家族的基因數量和表達模式與擬南芥有所不同。目前為止對水稻中AGO的研究相對較少。在本研究中，我們以分析OsAGOs表達模式和共表達網絡為重點，對水稻AGO家族進行系統(tǒng)的生物信息學分析。主要研究結果如下:
　　

2、 1、水稻中共有19個AGO基因，大部分OsAGO基因和蛋白質具有相似理化性質。19個AGO基因集中分布在第1、2、3、4、6、7染色體上。
　　 2、OsAGO基因家族有3對串聯復制基因和4對大片段復制基因。復制基因的表達模式有三種情況，即相似的表達情況、互補的表達情況和一個基因在所有組織中均表達而另一個基因在幾乎所有組織中均不表達或者表達量很低。
　　 3、大多數OsAGO基因在生殖生長階段呈現特異表達或者優(yōu)先表達

3、，尤其在稻穗中的表達水平明顯上調。6個OsAGO基因在經過GA3，KT，NAA的處理后表現出表達水平上調或者下調。3個OsAGO基因對光照或者暗處理有響應。
　　 4、10個OsAGO基因與DCL(Dicer-like)、RDR（RNA-dependentRNApolymerase）、DRB(Double-strandedRNABinding)等基因共表達，它們可能參與包括RNAi在內的一些RNA調控的相關途徑。OsAGOs基因

4、與17類編碼轉錄因子的基因共表達，表明它們可能與這些轉錄因子共同參與成花轉變、對激素的響應等各種不同功能。另外，OsAGO基因還與花粉發(fā)育相關基因、花藥發(fā)育相關基因等存在共表達的關系，且OsAGO基因家族成員之間也存在共表達的關系。
　　 5、OsAGO14基因的T-DNA插入突變體的稻穗明顯縮短且種子數量減少、種子中出現雙胚或者多穎殼的現象。
　　 以上的分析結果均為解析水稻OsAGOs的功能及進一步闡述RNA干涉的分