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文檔簡介
1、雜色鮑(Haliotis diversicolor)是我國東南沿海普遍養(yǎng)殖的經濟鮑類,由于長期采用人工近交繁殖,造成了其種質優(yōu)良性狀退化、抗逆性差,及時的對其開展遺傳育種改良工作顯得十分必要。本實驗所用雜色鮑均為養(yǎng)殖群體,野生群體由于捕撈過度等原因已經很難采樣,從分子水平對雜色鮑養(yǎng)殖群體進行遺傳多樣性研究是種質改良的基礎,也是雜色鮑養(yǎng)殖業(yè)持續(xù)健康發(fā)展的需要,而我國在南方養(yǎng)殖鮑的分子遺傳研究方面進展較慢,至今未見國內出現有關微衛(wèi)星研究雜色
2、鮑遺傳多樣性的報道。
本研究通過對本實驗室設計的一批雜色鮑微衛(wèi)星引物進行篩選,并在雜色鮑養(yǎng)殖群體中進行遺傳結構分析,在雜色鮑家系中進行遺傳模式的評估,以期獲得一定數量的雜色鮑SSR引物及其最佳擴增條件,為進一步進行雜色鮑分子遺傳育種研究提供可用的SSR標記和參考數據:
1.引物篩選:用雜色鮑混合DNA模板對83對雜色鮑SSR引物進行篩選,并優(yōu)化反應條件,由此獲得了80對可用SSR標記;分別從三亞、北海、臨高3
3、地采集了3個雜色鮑養(yǎng)殖群體各30個個體,在80對SSR標記的最佳反應條件下進行擴增,最終篩選出66對擴增良好的微衛(wèi)星位點。
2.群體遺傳結構分析:3個不同地點的雜色鮑養(yǎng)殖種群間平均FST值為0.1076,遺傳分化程度中等;三亞、北海、臨高種群的等位基因數依次為3.6、3.7、3.6,期望雜合度(HE)依次為0.45614、0.48423、0.49343,觀測雜合度(HO)依次為0.39647、0.40000、0.40404
4、;上述結果為養(yǎng)殖雜色鮑的遺傳多樣性監(jiān)測提供了依據,顯示出3個雜色鮑養(yǎng)殖種群目前狀態(tài)良好,并通過對比分析發(fā)現了適用于遺傳多樣性研究的微衛(wèi)星位點。
3.家系遺傳模式分析:選用同一養(yǎng)殖場不同年份的2個家系,用家系親本對可用的80個微衛(wèi)星位點進行篩選,得到16個擴增良好且有分離的位點,用其對2個家系進行遺傳模式分析,發(fā)現3個位點(HUHD19、HUHD34、HUHD35)在家系N中、2個位點(HUHD40、HUHD57)在家系Z中
5、為父母本呈多態(tài)且子代遵循孟德爾共顯性遺傳,同時也發(fā)現部分不適用于家系分析的微衛(wèi)星位點;通過2個家系多態(tài)位點的比較發(fā)現該養(yǎng)殖廠的雜色鮑家系由于累代近交已經出現雜合度減少的趨勢。
4.用66個微衛(wèi)星位點對3地雜色鮑養(yǎng)殖群體進行遺傳結構分析發(fā)現,有15.15%的位點在3個種群中均偏離哈代-溫伯格平衡(HWE);用16個SSR位點分析2個雜色鮑家系的遺傳模式時同樣發(fā)現,有62.5%的基因型比例不符合孟德爾遺傳分離;這種情況主要是由
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