基于深度學習的癌癥分類模型研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、癌癥基因組學是當前遺傳生物學和生物醫(yī)學領域的重點研究方向,關于癌癥致病原理的研究能夠有效地指導制定合理的癌癥治療方案和研發(fā)癌癥治療藥物。另一方面,由于高通量基因測序儀器的發(fā)展,個人的基因測序成本大大降低,癌癥治療逐漸向個性化治療發(fā)展,而根據(jù)基因測序數(shù)據(jù)對癌癥患病進行預測對于癌癥的早期診斷和治療都有很大的幫助。
  本文提出了基于深度置信網(wǎng)絡的癌癥分類模型,利用 TCGA計劃提供的3281名癌癥病人的測序數(shù)據(jù),能夠根據(jù)癌癥病人的測序

2、數(shù)據(jù)進行癌癥患病的分類預測,同時能夠挖掘模型中隱藏的針對不同癌癥疾病的突變基因模式和規(guī)律。本文的主要工作集中在兩個方面:(1)針對癌癥分類預測問題,本文采用的DBN模型通過無監(jiān)督預訓練和有監(jiān)督訓練調整相結合的訓練方式,逐層提取了癌癥病人測序數(shù)據(jù)中的特征,同時利用這些層次化的特征數(shù)據(jù)來進行分類預測,最終在分類性能上超越了SVM、MLP等分類模型。(2)針對癌癥突變基因模式和規(guī)律的挖掘,本文采用了網(wǎng)絡結點激勵最大化算法和統(tǒng)計方法相結合的方式

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