改進的非負矩陣分解算法在miRNA與基因互作關系的研究.pdf

1、miRNA是近年來發(fā)現(xiàn)的一種非編碼的小分子單鏈RNA，一般長度約為22個核苷酸。從被發(fā)現(xiàn)命名、大規(guī)模挖掘、對靶基因進行鑒定和預測以來，miRNA受到了廣泛的關注。miRNA主要通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的機制和調(diào)控多樣性的靶基因廣泛地影響著生物體的各種生理病理進程。目前，越來越多的研究人員對miRNA在各種疾病的診斷和治療等方面的應用寄予了極高的厚望。本文利用非負矩陣分解算法和粒子群優(yōu)化算法對miRNA與基因的互作關系展開了深入的探索，主要包括如下

2、。
　　首先本文采用非負矩陣分解算法對miRNA、基因數(shù)據(jù)進行整合，在基于已知的基因與基因互作數(shù)據(jù)和已知的 miRNA與基因互作關系上，得出了50對新的miRNA與基因互作關系對，同時用收斂圖檢測了本算法在這問題上是收斂有效的，并對這50個關系對的生物學意義做部分闡述；其次，由于非負矩陣分解算法在對miRNA與基因整合時，并沒有考慮到得出的miRNA與基因互作關系的生物學統(tǒng)計意義，我們在基于上述算法的基礎上，引入粒子群優(yōu)化算法，對