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文檔簡介
1、【背景】
MicroRNA是近年發(fā)現(xiàn)的一類長約21-25個(gè)核苷酸片段的非編碼的小分子RNA,其通過與靶mRNA3‘非翻譯區(qū)結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄后水平形成RNA誘導(dǎo)的基因沉默復(fù)合體影響mRNA的翻譯,從而發(fā)揮其生物學(xué)功能,影響生物體發(fā)育,細(xì)胞增殖、凋亡、分化等。其在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展方面也有著重要的作用。胃癌作為世界上發(fā)病率第四、腫瘤相關(guān)性死亡率第二的疾病,像其它惡性腫瘤一樣,其發(fā)生、發(fā)展也受遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)多級聯(lián)的復(fù)雜調(diào)控。雖然很多研
2、究證明microRNA與胃癌存在密切的相關(guān)性,但其在胃癌的功能及潛在的機(jī)制仍然不明。一些研究已經(jīng)證實(shí)胃癌組織中存在很多microRNA分子的差異表達(dá),并且發(fā)揮著促癌基因或抑癌基因的作用。我們參考國內(nèi)外相關(guān)文獻(xiàn)關(guān)于胃癌microRNA表達(dá)譜的研究,初步預(yù)測microRNA-148a/b在胃癌中存在著差異表達(dá),并發(fā)揮著特殊的生物學(xué)功能。本課題將對microRNA-148a/b在胃癌的表達(dá)水平及功能與作用機(jī)制進(jìn)行初步的探討。
【目的
3、】
1、檢測microRNA-148a/b在胃癌組織中的表達(dá)水平。
2、研究microRNA-148a/b在胃癌中的功能。
3、構(gòu)建microRNA-148a/b慢病毒表達(dá)載體。
4、探討microRNA-148a/b在胃癌發(fā)揮功能的可能機(jī)制。
【方法】
1、收集23例胃癌患者手術(shù)切除后的腫瘤組織及癌旁組織標(biāo)本,提取組織中的總RNA,qPCR檢測microRNA-148a/b在
4、癌組織和癌旁組織中的相對表達(dá)量,使用相對定量法分析其表達(dá)差異。
2、運(yùn)用microRNA-148a/b-mimics化學(xué)合成物,通過脂質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的方法,轉(zhuǎn)染人胃癌MKN28,SGC7901細(xì)胞,使胃癌細(xì)胞內(nèi)microRNA-148a/b水平升高,進(jìn)行劃痕和transwell遷移實(shí)驗(yàn),測定其對胃癌細(xì)胞遷移能力的影響。
3、構(gòu)建microRNA-148a/b慢病毒過表達(dá)載體,經(jīng)測序鑒定正確后,進(jìn)行病毒的包裝與滴度檢測。
5、并用構(gòu)建好的microRNA-148a/b慢病毒表達(dá)載體感染人胃癌SGC7901細(xì)胞,qPCR鑒定microRNA-148a/b在感染細(xì)胞中的表達(dá)效果。
4、運(yùn)用生物信息學(xué)分析軟件TargetScan、MiRanda預(yù)測microRNA-148a/b可能的靶基因,并對預(yù)測結(jié)果應(yīng)用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行功能聚類分析,選擇與抑制細(xì)胞侵襲、遷移能力相關(guān)的抑癌相關(guān)基因。對其預(yù)測的靶基因編碼蛋白用Western-blot方法進(jìn)行檢測其在m
6、icroRNA-148a/b上調(diào)胃癌細(xì)胞MKN28內(nèi)的表達(dá)變化。
【結(jié)果】
1、MicroRNA-148a/b在胃癌組織中表達(dá)顯著低于相對應(yīng)的癌旁組織。
2、劃痕實(shí)驗(yàn)和transwell實(shí)驗(yàn)提示,運(yùn)用miR-148a/b-mimics通過脂質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)染使胃癌細(xì)胞MKN28和SGC7901內(nèi)miR-148a/b升高,腫瘤細(xì)胞遷移能力顯著減弱。
3、成功構(gòu)建了microRNA-148a和microRN
7、A-148b的兩個(gè)慢病毒表達(dá)載體,經(jīng)雙酶切電泳及測序鑒定正確。用構(gòu)建好的慢病毒載體感染人胃癌SGC7901細(xì)胞,qPCR鑒定其表達(dá)效果,結(jié)果顯示能顯著上調(diào)microRNA-148a/b在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)水平。
4、生物信息學(xué)預(yù)測顯示PrPc為microRNA-148a/b的可能靶基因之一,Western-bolt結(jié)果顯示,在microRNA-148a/b上調(diào)的胃癌細(xì)胞MKN28內(nèi),PrPc表達(dá)顯著降低。
【結(jié)論】
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