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文檔簡介
1、目的: 應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF-MS)技術(shù),選擇西醫(yī)病種胃癌(GC)患者、消化性潰瘍(PU)患者及慢性胃炎(CG)患者,根據(jù)舌苔及病證結(jié)合分組,并與同齡正常組對照,進行唾液蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,以闡明脾虛證與腎虛證在蛋白質(zhì)組水平上的唾液特異性微觀特
2、征,并應(yīng)用生物信息學(xué)手段篩選證候最優(yōu)化蛋白質(zhì)組合并初步建立脾虛、腎虛病證結(jié)合診斷模型;并從蛋白質(zhì)組水平初步探討中醫(yī)同病異證、異病同證的現(xiàn)代科學(xué)基礎(chǔ);同時,建立具有中醫(yī)特色的唾液蛋白質(zhì)組無創(chuàng)傷診斷技術(shù),推動促進微觀辨證學(xué)的發(fā)展和中醫(yī)診斷學(xué)的現(xiàn)代化。 方法: 采集95例唾液標(biāo)本,其中正常對照者20例均為健康體檢正常者,胃癌患者34例,消化性潰瘍患者20例,慢性胃炎患者21例。所有疾病患者均經(jīng)過胃鏡和/或術(shù)后組織病理檢測明確診
3、斷。按病證結(jié)合分為以下三大組:(1)異病異證分組:即以證候為綱進行分組,全部病例按虛證辨證標(biāo)準分為脾虛、腎虛、其他證候3組與正常組進行比較研究。(2)同病異證分組:將胃癌分別按虛證辨證標(biāo)準分為脾虛、腎虛、其他證候3組與正常組進行比較研究。(3)西醫(yī)病種分組:比較正常對照者與3種疾病及疾病之間蛋白質(zhì)表達譜的差異。(4)按不同舌苔分組:比較正常薄白苔與三種病理舌苔之間蛋白質(zhì)表達譜的差異。采用德國BRUKER公司的WCX磁珠及Autoflex
4、Ⅲ MALDI-TOF質(zhì)譜儀對全部患者和正常人的唾液進行蛋白質(zhì)表達譜的檢測。設(shè)定所有唾液樣本檢測的蛋白質(zhì)采集相對分子量范圍為1000~10000Da。所得到的蛋白質(zhì)以肽質(zhì)量指紋圖(PMF)的形式表示。然后使用BRUKER公司的數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)(其中包括一個配套的標(biāo)峰和校正峰的軟件FlexAnalysis3.0和統(tǒng)計學(xué)分析軟件ClinProTools2.1)對每個組合內(nèi)的相同質(zhì)荷比不同含量的蛋白進行分析比較,找到組合內(nèi)蛋白含量有顯著差異的質(zhì)荷
5、比峰。將組合內(nèi)含量有顯著差異(P<0.05)的蛋白質(zhì)波峰建立分類預(yù)測模型,選擇相應(yīng)條件,用統(tǒng)計分析軟件ClinProTools2.1對其進行分組統(tǒng)計,從而得到各組的特異性蛋白標(biāo)志物并初步建立相應(yīng)疾病、證候及病證結(jié)合的唾液蛋白質(zhì)組診斷模型。用隨機抽樣方法(隨機選擇80%樣本建立模型,其余的20%作為驗證樣本,共運行十次),驗證模型的有效性(平均特異性、靈敏性及平均準確率)。用SPSS13.0軟件進行各組基線值的比較,年齡的比較采用單因素方
6、差分析,所有數(shù)據(jù)用x±s表達,性別構(gòu)成的比較采用X2檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。 結(jié)果: 1.按異病異證分組:將所有患者分為脾虛、腎虛、其他證候3組加上正常組共79例樣本,對所有的樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,共得到蛋白質(zhì)峰為175個,其中通過遺傳算法找到了10個差異顯著的蛋白峰,其質(zhì)荷比(m/z)分別為:7447.22Da、3963.26Da、7911.59Da、1390.85Da、6574.69Da、1167
7、.54Da、1230.73Da、7846.3Da、2724.41Da、2223.89Da。在此基礎(chǔ)上建立了分類預(yù)測模型,識別率為89.15%,預(yù)測能力38.63%。回代檢驗結(jié)果正常組19例全部被準確檢出,19例脾虛患者,其中16例被準確檢出,21例腎虛患者,有18例被準確檢出,20例其他證候患者,有17例被準確檢出。該模型的準確率為88.61%(70/79)。 2.按同病異證分組:胃癌脾虛、胃癌腎虛、胃癌其他證候3組和正常組共4
8、8例,對樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,共得到蛋白質(zhì)峰為161個,其中通過遺傳算法找到10個差異顯著的蛋白峰,質(zhì)荷比(m/z):8840.72Da、3442.42Da、4120.81Da、3492.63Da、6558.43Da、5583.29Da、3286.1Da、4419.3Da、5527.57Da、3923Da。通過分析差異蛋白建立了分類預(yù)測模型,識別率為80.97%,預(yù)測能力33.47%:回代檢驗結(jié)果正常組19例,其中17例被準確檢出
9、,10胃癌脾虛患者全部被準確檢出,11例胃癌腎虛患者,其中7例被準確檢出,其他證候組8例,有6例被準確檢出,該模型的準確率為83.33%(40/48)。 3.按西醫(yī)病種分組:①正常對照組與胃癌組兩組樣本共41例,對所有的樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,兩個組共得到蛋白質(zhì)峰為74個,其中14個統(tǒng)計差異顯著的蛋白峰(P<0.05),選擇質(zhì)荷比(m/z)為1472.78Da、2936.49Da、6556.81Da和7081.17Da這四個
10、蛋白質(zhì)峰進行建模。其中發(fā)現(xiàn)胃癌患者1472.78Da峰處顯著高于正常人。通過對這4個蛋白峰的鑒別,建立了分類預(yù)測模型,識別率為97.83%,預(yù)測能力79.82%。臨床回代檢驗結(jié)果,23例胃癌患者中有22例被準確檢出為胃癌,18例正常組中所有18例全部被確定為非胃癌。結(jié)果表明,該診斷模型的準確率為97.56%(40/41),靈敏度為95.65%(22/23)特異度為100%(18/18)。②正常對照組與慢性胃炎組兩組樣本共32例,對所有的
11、樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,兩個組共得到蛋白質(zhì)峰為74個,其中5個有統(tǒng)計差異顯著的蛋白峰(P<0.05),選擇質(zhì)荷比(m/z)為:5502.36Da、1441.75Da和3442.47Da這3個相關(guān)蛋白峰建立分類預(yù)測模型,識別率為91.67%,預(yù)測能力73.33%。臨床回代檢驗結(jié)果14例慢性胃炎患者全部被準確檢出,18例正常組對照者,其中15例被正確檢出,該模型的準確率為90.63%(29/32),靈敏度為100%(14/14),特異度
12、為83.33%(15/18)。③正常對照組與消化性潰瘍組兩組樣本共35例,對所有的樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,兩組共得到66個蛋白質(zhì)峰,其中10個有統(tǒng)計差異顯著的蛋白峰(P<0.05),選擇質(zhì)荷比(m/z)為:2934.36Da、5502.38Da和3472.94Da這3個相關(guān)蛋白峰,通過分析這些差異蛋白表達譜建立了分類預(yù)測模型,識別率為88.40%,預(yù)測能力80.35%。臨床回代檢驗結(jié)果17例消化性潰瘍,其中14例被準確檢出,18例正
13、常組對照者,其中17例被正確檢出,該模型的準確率為88.57%(31/35),靈敏度為82.35%(14/17),特異度為94.44%(17/18)。④慢性胃炎組與胃癌組兩組樣本共37例,對所有的樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,兩組共得到77個蛋白質(zhì)峰,其中1個有統(tǒng)計差異顯著的蛋白峰,質(zhì)荷比(m/z)為:6021.72Da。通過分析這個差異蛋白表達譜建立了分類預(yù)測模型,其識別率為83.54%,預(yù)測能力為60.23%。⑤慢性胃炎組與消化性潰瘍
14、組兩組樣本共29例,對所有的樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,兩個組共得到蛋白質(zhì)峰為79個,運用統(tǒng)計分析軟件ClinProTools得出了最適宜的區(qū)分模式模型,該模型包括了4個相關(guān)峰,質(zhì)荷比分別為:3369.79Da、3472.13Da、2900.2Da和3489.29Da,通過分析這些差異蛋白表達譜,并建立了分類預(yù)測模型,該模型的識別率92.86%,模型預(yù)測能力56.87%。⑥消化性潰瘍組與胃癌組樣本共42例,對所有的樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析
15、比較,兩個組共得到蛋白質(zhì)峰為77個,差異蛋白的分析建模有待進一步進行。 4.按舌苔分組:正常薄白苔與三組病理舌苔(包括病理薄苔、病理厚苔和病理剝苔)共75例,對所有的樣本檢測質(zhì)譜圖進行分析比較,共得到蛋白質(zhì)峰為187個,其中4個有統(tǒng)計差異顯著的蛋白峰(P<0.05),質(zhì)荷比分別為:6447.39Da、2938.47Da、1472.34Da、1451.77Da,通過分析這些差異蛋白峰表達譜,并建立了分類預(yù)測模型,識別率為85.31
16、%,預(yù)測能力39.91%。對正常組19例,有18例被準確檢出,56例病理組,其中40例被準確檢出,該模型的準確率為85.33%(64/75)。 結(jié)論: 本研究利用MALDI-TOF-MS技術(shù)對健康對照組、胃癌組、消化性潰瘍組和慢性胃炎組患者的唾液中的蛋白質(zhì)進行表達譜的檢測,從唾液蛋白質(zhì)組初步篩選出了可用于臨床病證結(jié)合診斷的特異生物標(biāo)記物,并探索建立了相關(guān)病證結(jié)合的診斷模型。該方法與傳統(tǒng)疾病生物標(biāo)志物相關(guān)的檢測方法比較,具
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