膽固醇酯轉運蛋白抑制劑的藥效團模型構建和分子對接研究.pdf

1、膽固醇酯轉運蛋白(CETP)是一種血漿糖蛋白，它介導膽固醇酯(CE)從高密度脂蛋白(HDL)到低密度脂蛋白(LDL)和極低密度脂蛋白(VLDL)，同時將等量的甘油三酯(TG)分子反向轉運。CETP轉運的過程會降低有抗動脈硬化作用的HDL的濃度，而提高有致動脈硬化作用的LDL和VLDL的濃度。因此，抑制CETP轉運將成為一種治療心血管疾病的潛在作用靶標。
　　 實驗以CETP抑制劑為研究目標，通過使用計算機輔助藥物設計Cataly

2、st軟件的定量的HypoGen模塊和定性的HipHip模塊分別構建了CETP抑制劑的三維藥效團模型。HypoGen模型的訓練集由25個體外生物活性IC50分布在1.2nM到100000 nM之間的氨基醇類衍生物組成，構建的模型包括1個疏水脂肪鏈，1個氫鍵受體，2個芳香環(huán)。模型經(jīng)過用29個化合物進行測試，結果表明模型能較好的預測出不同活性的化合物。HipHip模型的訓練集由6個高活性的結構不同的CETP.抑制劑組成，最終得到的模型包括3個

3、疏水基團，1個氫鍵受體。
　　 對接計算采用Dock6.2軟件，取復合物中原配體周圍10 A范圍為活性位點對不同結構的36個化合物進行分子對接，根據(jù)對接的結果，比較了不同抑制劑在與CETP對接時結合模式的異同，主要從疏水作用的角度對這些抑制劑活性的差異性進行了一些初步探討。研究不同種類的小分子抑制劑與CETP受體的結合模式，初步確定了抑制劑與受體相互作用的可能的結合位點。
　　 實驗結論和方法為進一步研究CETP抑制劑提