GO術語間語義相似性的度量方法.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、關于相似性的研究在很多研究領域里都起到了關鍵作用。相似性的研究主要包括結構的相似性和語義的相似性。以往對結構相似性的關注和研究比較多，近幾年，語義相似性吸引了越來越多的注意。 由于歷史原因所致，生物學數(shù)據(jù)來源非常復雜。為了減少或消除概念及術語的混亂，Gene Ontology協(xié)會開發(fā)了生物學數(shù)據(jù)的大型語義詞典--基因本體GO(Gene ontology)。GO應用的一個重要方面就是對GO術語的語義相似性進行度量。通常認為，如果兩

2、個基因產物的功能相似，那么它們的基因表達就相近，同時它們在GO中注解的術語就相似，所以我們只要能找出GO中術語對的相似度，就可以近似估計兩基因表達的相似度，從而判斷兩基因產物功能的相似程度。所以說，GO術語間語義相似性的度量是解決生物學數(shù)據(jù)集成中語義異構問題的重要方法。 本文首先介紹了關于GO的背景知識和對于語義相似性的研究；接著分析了當前GO術語間語義相似性的幾種常用度量方法；然后主要針對其中最常用的一種提出了改進的措施——基

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