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文檔簡介
1、本文分別用數量遺傳學、分子遺傳學、生化遺傳學、生物信息學研究奶牛的耐熱性能。具體工作及結論如下: (1)南方中國荷斯坦牛耐熱性相關參數的研究本研究采用公畜內半同胞相關法,分別從產奶量(350頭)、耐熱產奶量(116頭)、直腸溫度(200頭)和紅細胞鉀(144頭)四個方面估算奶牛群體遺傳力,結果分別是0.334、0.196、0.20、0.318。運用BLUP法估算以色列公牛育種值最高,為85.12。對數據進行回歸分析得到方程:y=
2、-0.23853-0.0096x<,1>+0.000827x<,2>(x<,1>為直腸溫度,x<,2>為紅細胞鉀含量>。在兩個變量中,只有紅細胞鉀含量顯著的通過了t檢驗(P<0.05)。 (2)南方中國荷斯坦牛耐熱性RAPD標記研究及生物信息學分析以52頭高產耐熱組和41頭高產不耐熱組中國荷斯坦牛的DNA為材料,選用200條RAPD引物,利用PCR-RAPD技術,對荷斯坦牛的耐熱性進行研究。結果發(fā)現,使用S441引物和S463引
3、物在高產耐熱組中分別發(fā)現了581bp和800bp特異性的片段(與奶牛耐熱性有關的RAPD的標記),回收、克隆、并測定了581bp、680bp 片段的序列。序列比較顯示,581bp的片段與KCNN2基因的同源性達90%,其可能是KCNN2基因的內含子3;680bp 片段與 NW_001024067.1同源性達99%,NW_001024067.1的功能未知。根據己知KCNN2基因的功能,初步判斷KCNN2基因為耐熱性能的候選基因。把581b
4、p(RAPD-S441標記)和680bp (RAPD-S463標記)片段提交到Genbank,得到登陸號EF123743和EF123744。利用NCBI的ORF finder在581bp片段中沒有發(fā)現ORF,這與上一步預測結論相符合。在680bp片段中發(fā)現4個ORF,分別為ORF1、ORF2、ORF3、ORF4。這4個閱讀框分別編碼48AA、34AA、45AA、34AA。并成功將RAPD-S41標記成功轉化為SCAR標記。 (3
5、)南方中國荷斯坦牛耐熱性SCAR標記研究根據RAPD-S441、RAPD-S463標記的測序結果,利用Premier5.0軟件設計對應的SCAR引物。本研究成功將RAPD-S441標記耐熱SCAR標記。其能很好的區(qū)分高產耐熱組和高產不耐熱組。而RAPD-S463,沒有轉換成SCAR標記。 (4)南方中國荷斯坦牛SSR標記研究本論文在牛6號染色體上,均勻選擇了9個微衛(wèi)星標記 (ILSTS093、DIK2029、MNB_66、BL1
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