脲原體拓?fù)洚悩?gòu)酶基因突變與喹諾酮類耐藥的相關(guān)性研究.pdf_第1頁(yè)
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1、脲原體包括微小脲原體(Ureaplasma parvum,Up)和解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum,Uu),是引起人類非淋球菌性生殖道感染的主要支原體類病原體之一。由于脲原體缺乏細(xì)胞壁結(jié)構(gòu),故阻礙細(xì)胞壁合成的抗生素如青霉素類、頭孢菌素類等對(duì)脲原體感染天然無(wú)效。四環(huán)素類、大環(huán)內(nèi)酯類及喹諾酮類抗生素是治療脲原體感染的主要有效藥物。由于抗生素的大量使用及使用不當(dāng),脲原體的耐藥現(xiàn)象日趨嚴(yán)重,尤其對(duì)喹諾酮類氧氟沙星和環(huán)丙沙

2、星的耐藥率分別已高達(dá)30%和60%多,久治不愈的病例屢見(jiàn)不鮮,國(guó)內(nèi)外對(duì)其耐藥機(jī)制研究亦逐漸增多.對(duì)喹諾酮類耐藥的機(jī)制主要與編碼拓?fù)洚悩?gòu)酶II(gyrA/gyrB)和拓?fù)洚悩?gòu)酶IV(parC/parE)亞單位的基因突變有關(guān)。但目前國(guó)內(nèi)外對(duì)脲原體的耐藥判斷都缺乏一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化的研究方法,這就阻礙了脲原體耐藥株的準(zhǔn)確判斷,以及后續(xù)抗生素耐藥情況和基因突變結(jié)果之間的相關(guān)性比較。
   本研究在Beeton等研究方法的基礎(chǔ)上進(jìn)行改良,在96孔

3、板上利用微量肉湯稀釋法對(duì)樣本中脲原體菌量和對(duì)喹諾酮類藥物的MIC用斷裂點(diǎn)分析法同時(shí)進(jìn)行測(cè)定,確定真正的脲原體喹諾酮類耐藥株。收集瑞金醫(yī)院2009.7-12月的門診非淋球菌性尿道炎患者泌尿生殖道標(biāo)本435例,隨機(jī)測(cè)定了66份樣本脲原體的精確MIC,同時(shí)對(duì)脲原體陽(yáng)性株產(chǎn)物進(jìn)行基因組提取、PCR擴(kuò)增喹諾酮類耐藥基因gyrA、gyrB、parC和parE,測(cè)序并和NCBI基因庫(kù)中標(biāo)準(zhǔn)菌株進(jìn)行比對(duì),以發(fā)現(xiàn)新的耐藥基因突變位點(diǎn)及本地區(qū)耐藥菌株流行趨

4、勢(shì),以圖進(jìn)一步闡明脲原體對(duì)喹諾酮類耐藥的作用機(jī)制。首先,通過(guò)改良棋盤稀釋法測(cè)定66份樣本的MIC發(fā)現(xiàn),和臨床上常用的梅里埃的IST2脲原體試劑盒(下面簡(jiǎn)稱藥敏卡法)相比,在棋盤稀釋法確定的環(huán)丙沙星、氧氟沙星敏感的解脲脲原體中,藥敏卡法分別將50%(5/10)和48.1%(13/27)的敏感菌株判為中介/耐藥;而在棋盤稀釋法確定的環(huán)丙沙星耐藥的菌株中,藥敏卡法將4.4%(2/45)的菌株判為敏感。另外,通過(guò)擴(kuò)增脲原體陽(yáng)性株的喹諾酮類耐藥基

5、因gyrA、gyrB、parC和parE,測(cè)序并與基因庫(kù)中標(biāo)準(zhǔn)株比對(duì)發(fā)現(xiàn):⑴49份耐藥標(biāo)本中,僅15號(hào)一例出現(xiàn)有意義的gyrA突變,即M109K,突變率2.04%(1/49)。⑵26份出現(xiàn)parC突變,突變率53.06%(26/49)。其中23份均出現(xiàn)S83L 的突變,與國(guó)內(nèi)外報(bào)道一致,突變率為46.94%(23/49);新發(fā)現(xiàn)了R68P、M89I、A117G突變。⑶有3份發(fā)生了parE突變,突變率6.12%(3/49)。分別是A457

6、T、E467K和R448K、G476R。⑷10份中介標(biāo)本中有一份發(fā)生了parC的S83L突變,突變率為10%(1/10)。⑸10份中介標(biāo)本中7份發(fā)生了gyrA基因D112E變異,1份敏感標(biāo)本也發(fā)生gyrA基因D112E的變異;另外49份耐藥標(biāo)本中也有38份發(fā)生D112E的變異,這個(gè)變異在以前被認(rèn)為與喹諾酮類耐藥高度相關(guān),但Beeton認(rèn)為D112E只是非耐藥相關(guān)的種屬特異的多態(tài)性表現(xiàn),我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果也證實(shí)了這個(gè)結(jié)論。⑹60份標(biāo)本中除了1

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