非小細胞肺癌的血清蛋白質組學研究.pdf

1、目的：目前肺癌診斷缺少有效的早期診斷方法，通過對非小細胞肺癌患者血清及正常對照的血清作蛋白質組學分析，運用血清蛋白質組學技術把兩者區(qū)分開來，并探索新的肺癌生物標志物以達到早期診斷的目的。 方法：首先通過非標記定量一維液相色譜串聯(lián)質譜的方法，分析了8例非小細胞肺癌患者及8例正常對照血清，對得到的血清蛋白質數(shù)據(jù)運用生物信息學統(tǒng)計方法包括系統(tǒng)聚類分析及主成分分析等方法進行統(tǒng)計分析。在此研究基礎上，我們進一步對8例肺腺癌、5例肺鱗癌及5

2、例正常對照血清樣本運用二維液相色譜串聯(lián)質譜技術進行分析，對得到的肺癌血清蛋白質組數(shù)據(jù)繼續(xù)運用生物信息學方法進行統(tǒng)計分析，并從差異表達的蛋白質中通過文獻復習尋找有作為肺癌生物標志物潛力的蛋白質。 結果：⑴采用液相色譜串聯(lián)質譜的非標記定量技術對8例正常人血清和8例非小細胞肺癌患者血清進行分析，這16例樣品共得到含有3358個定量信息蛋白質的數(shù)據(jù)庫，通過歸一化和隨機配對t檢驗(p<0.05)后，得到62個差異表達的蛋白質，有208種蛋

3、白質在16例血清樣本中均表達。采用這62個蛋白質，進行系統(tǒng)聚類分析顯示，可以通過這組蛋白從整體上將正常人和肺癌患者區(qū)分開來；進一步，我們采用主成分分析、支持向量機等生物信息學方法進行分析，得到了一系列可能與肺癌的發(fā)生、發(fā)展及預后相關的蛋白質。⑵根據(jù)實驗結果，對8例肺腺癌患者血清、5例肺鱗癌患者血清及5例正常對照采用基于二維液相色譜分離串聯(lián)質譜的非標記定量技術進行分析，通過對蛋白質樣品分離技術的改進，鑒定到的蛋白質數(shù)目由原來的300個左右

4、/例增至1000個左右/例。采用326個差異表達蛋白質，進行系統(tǒng)聚類分析顯示，可以通過這組蛋白質從整體上將正常人、肺腺癌及肺鱗癌患者區(qū)分開來；在三類血清樣本蛋白質數(shù)據(jù)主成分分析中，有一例正常樣本及肺腺癌樣本與肺鱗癌不能很好區(qū)分。同樣通過86種差異表達的蛋白質，可以把正常與肺腺癌患者進行區(qū)分；通過162種差異表達的蛋白質把正常對照與肺鱗癌區(qū)分；同時，我們在肺腺癌與肺鱗癌中鑒定出了103種差異表達的蛋白質，系統(tǒng)聚類分析可以從整體上把兩者很好