VGLL4和NOTCH4基因單核苷酸多態(tài)性與肺癌易感性的研究.pdf

1、中科院上海生命科學(xué)研究院近期在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Cell Research刊發(fā)了一項(xiàng)最新研究成果[7]，他們發(fā)現(xiàn)了導(dǎo)致肺癌發(fā)生的新抑癌基因VGLL4基因。研究表明，VGLL4異常表達(dá)與肺癌、肝癌等多種癌癥的發(fā)生發(fā)展相關(guān)，VGLL4基因表達(dá)下調(diào)是導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的可能原因，但是對(duì)于其下調(diào)的機(jī)理還未見有報(bào)道，而外顯子的突變可以直接導(dǎo)致蛋白的變化或蛋白結(jié)構(gòu)的改變，從而導(dǎo)致蛋白的功能改變。據(jù)此我們選取了該基因編碼區(qū)的同義突變位點(diǎn)rs1803489（A/G

2、，Gln/Gln）和錯(cuò)義突變位點(diǎn)rs2276749(C/T, Met/Ile)兩個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行分析研究：同時(shí),在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過(guò)程中，Notch信號(hào)扮演著重要的角色，單一的Notch信號(hào)的紊亂可能直接引發(fā)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展，而通路的異?？捎捎诨蛲蛔儗?dǎo)致的蛋白表達(dá)變化而引起。因此，我們選取了位于NOTCH4基因外顯子區(qū)的同義突變位點(diǎn)rs3134942(A/C, Val/Val)作為研究對(duì)象。
　　為了研究?jī)蓚€(gè)基因的三個(gè)位點(diǎn)與肺癌

3、易感性的關(guān)系，我們選取了375例肺癌患者外周血作為研究對(duì)象，和380例健康人群外周血作為正常對(duì)照組。首先我們根據(jù)不同的位點(diǎn)設(shè)計(jì)不同的引物，然后通過(guò)PCR擴(kuò)增和非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳，選取電泳條帶清晰、單一無(wú)雜帶的退火溫度進(jìn)行高分辨率熔解曲線（High Resolution Melting，HRM）上機(jī)實(shí)驗(yàn)。然后利用Roche480 Lightcycler Software對(duì)高分辨率熔解曲線進(jìn)行分析，根據(jù)曲線形成的形狀和顏色對(duì)樣本進(jìn)行分

4、型，最后通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析這三個(gè)多態(tài)位點(diǎn)與肺癌易感性的關(guān)聯(lián)性。
　　研究結(jié)果表明：（1）研究對(duì)象基本資料比較結(jié)果顯示，在375例肺癌病例和380例對(duì)照樣本中：肺癌病例與正常對(duì)照在年齡、吸煙與飲酒狀況存在差異（p值均＜0.05），而性別沒有顯著差異（p=0.825），說(shuō)明肺癌的發(fā)生是多因素誘導(dǎo)的結(jié)果。VGLL4基因的兩個(gè)多態(tài)位點(diǎn)基因型分布顯示：在超顯性遺傳模型下，同義突變r(jià)s1803489多態(tài)性位點(diǎn)與肺癌易感性具有顯著顯著相關(guān)性，其中G

5、A基因型會(huì)提高其個(gè)體的肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)（Adjusted OR=1.42,95％CI:1.00-2.00, p=0.048），是GG基因型攜帶者肺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的1.42倍?；谏鲜鲞z傳模型，我們對(duì)其進(jìn)行了分層分析，結(jié)果顯示：小于60歲的人群中該位點(diǎn)GA基因型與肺癌有著顯著的相關(guān)性（Adjusted OR=1.96,95%CI:1.23-3.14, p=0.005）。我們的研究結(jié)果提示錯(cuò)義突變位點(diǎn)rs2276749與肺癌易感性無(wú)顯著相關(guān)性。（2