應用蛋白質組學技術篩選胃癌細胞差異表達蛋白.pdf

1、目的：通過使用雙向電泳技術，分離并篩選低分化胃癌細胞(BGC-823)、中分化胃癌細胞(SGC-7901)及正常胃粘膜細胞(GES-1)差異表達蛋白。結合MALDI-TOF-TOF-MS/MS串聯(lián)質譜進行差異蛋白的鑒定。鑒定出的差異蛋白可作為腫瘤標志物，為闡述胃癌的發(fā)病機制、臨床上早期診斷及預后判斷提供理論依據(jù)。
　　 方法：⑴體外培養(yǎng)低分化胃癌細胞(BGC-823)、中分化胃癌細胞(SGC-7901)及正常胃粘膜細胞(GES-

2、1)，分別提取蛋白，采用雙向電泳技術分離蛋白，使用PDQuestTM2-D Analysis Software8.0軟件分析篩選差異蛋白。⑵篩選感興趣的差異蛋白位點，進行MALDI-TOF-TOF-MS/MS串聯(lián)質譜鑒定。
　　 結果：①應用雙向電泳技術成功分離低分化胃癌細胞(BGC-823)、中分化胃癌細胞(SGC-7901)及正常胃粘膜細胞(GES-1)的蛋白位點。發(fā)現(xiàn)GES-1細胞的電泳結果中總共有1403±17個蛋白位點

3、，BGC-823細胞及SGC-7901細胞的電泳結果分別得到1407±15、1406±11個蛋白位點。從GES-1細胞與BGC-823細胞之間配對后差異蛋白位點的結果中，發(fā)現(xiàn)有48個差異蛋白位點，表達上調的有22個，表達下調的有26個。從GES-1細胞與SGC-7901細胞之間配對后差異蛋白位點的結果中，發(fā)現(xiàn)有87個差異蛋白位點，表達上調得有47個，表達下調得有40個。②應甩MALDI-TOF-TOF串聯(lián)質譜在上述蛋白中，各選擇10個蛋

4、白位點(差異倍數(shù)大于2倍)進行質譜鑒定。成功鑒定出16個蛋白位點，其中有4個表達上調，12個表達下調。這些蛋白大致可分為：大致分為以下4類：(1)代謝相關酶類：焦磷酸酶1(PPA1)、磷酸甘油酸脫氫酶(PHGDH)、乳酸脫氫酶(LDHB)，烯醇化酶(ENO1)；(2)分子伴侶：熱休克蛋白90β(HSP90β)、熱休克蛋白70(HSP70)；(3)細胞骨架蛋白：角蛋白7(CK7)、膜突蛋白(Moesin)、核纖層蛋白(Lamin)；(4)

5、其他：泛醌蛋白1(UBQLN1)、γ肌動蛋白1(ACTG1)、谷胱甘肽S轉移酶(GSTP1)、人蛋白二硫化物異構酶A3(PDIA3)、胞質內(nèi)色氨酰tRNA合成酶(WARS)、T型復合蛋白β亞基(CCT2)、異質性核糖核蛋白(HNRNPF)。
　　 結論：⑴應用雙向電泳技術成功分離并篩選出與胃癌發(fā)生發(fā)展相關的差異蛋白。每張膠圖上成功分離1400多個蛋白位點，較高的分辨率有利于篩選差異蛋白。⑵利用MALDI-TOF-TOF-MS/M

6、S串聯(lián)質譜技術，成功鑒定出其中16個差異倍數(shù)在2倍以上蛋白位點，包括4個蛋白表達上調，12個蛋白表達下調。大致分為：代謝相關酶類、分子伴侶、細胞骨架等其他。其中焦磷酸酶1(PPA1)在低分化胃癌細胞BGC-823中的高表達，國內(nèi)外尚未見報道。乳酸脫氫酶(LDHB)、磷酸甘油酸脫氫酶(PHGDH)、γ肌動蛋白1(ACTG1)、人蛋白二硫化物異構酶A3(PDIA3)和T型復合蛋白β亞基(CCT2)，國內(nèi)尚未見報道。這些結果可為今后胃癌致癌機