對影響蛋白質螺旋結構中氫鍵形成因素的研究.pdf

1、本文是基于Chou-Fasman法則的計算原理，通過對Fasman法則計算公式的分析，并且對當初Chou-Fasman計算得到的結果進行了重新計算和優(yōu)化，得到了新的蛋白質二級結構傾向性因子值，同時從另一方面證明了Chou-Fasman法則的正確性。
　　 文章使用的數據均來源于PDB（蛋白質二級結構數據庫）數據庫，二級結構分類數據庫選擇的是SCOP數據庫，二級結構定義數據庫選擇的是DSSP（蛋白質二級結構定義數據庫）數據庫，。經

2、過自己開發(fā)的軟件將從網上下載得到的數據庫進行一定的轉換，為本課題提供服務，主要數據庫最終分為兩種：1，DSSP非冗余數據庫，其目的在于減少冗余度對本課題計算結果造成的誤差的影響；2，DSSP隨機數據庫，本數據庫做為計算結果的驗證集，目的在于驗證計算從非冗余數據庫中計算得到的結果。
　　 由于沒有現成的能滿足本課題需要的數據庫數據挖掘和數據分析處理軟件，因此在完成本課題之前需要自己設計開發(fā)一款軟件作為課題的硬件支持。本課題選用的是

3、Delphi7開發(fā)平臺，開發(fā)了課題專門的數據處理軟件。
　　 文章對長度為4的多肽模型進行了數據挖掘和分析處理，發(fā)現在這種模型出現的螺旋和非螺旋結構中，呈現出一種趨勢：當中間2，3位位點的螺旋傾向性因子值高于某個值時，和低于某個值時，這種模型將出現不同的二級結構，即：當中間位點的氨基酸殘基的Fasman傾向性均值大于1時，這種模型大多呈現螺旋結構，比例高達80％左右，當傾向性均值小于1時，這種模型很少呈現螺旋結構，比例高達70％