基于癌癥異質(zhì)性尋找前列腺癌相關(guān)新型miRNA調(diào)控的生物通路.pdf_第1頁(yè)
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1、癌癥異質(zhì)性一直是研究人員在分子表達(dá)分析過(guò)程中嘗試解決的問(wèn)題。本課題使用4組公開(kāi)的 microRNA芯片數(shù)據(jù)來(lái)評(píng)價(jià)考慮癌癥異質(zhì)性的芯片算法，分別是 LSOSS, COPA, MOST, ORT, OS以及傳統(tǒng)的t-test，得出結(jié)論要發(fā)現(xiàn)那些只在部分樣本中表達(dá)發(fā)生變化的microRNA，只能通過(guò)使用更適合的考慮癌癥異質(zhì)性的算法，而不是傳統(tǒng)的方法。這里，為了方便實(shí)驗(yàn)人員把這些算法運(yùn)用到自己的實(shí)際實(shí)驗(yàn)中去，我們還構(gòu)建了一個(gè)整合以上六種算法的具

2、有良好圖形用戶(hù)界面的 Java程序。通過(guò)比較不同層次上數(shù)據(jù)間一致性的差異，我們發(fā)現(xiàn)在系統(tǒng)和功能層次上能較好的找到不同實(shí)驗(yàn)組數(shù)據(jù)之間的共同點(diǎn)。分析上述4組數(shù)據(jù)后，最終得到了富集的38個(gè)GeneOntology條目，16個(gè)KEGG通路和99個(gè)GeneGo通路。在最顯著的15個(gè)GeneGo通路中，4個(gè)被之前的研究報(bào)道過(guò)，剩下的我們也通過(guò)分析通路中的組成基因來(lái)證實(shí)和前列腺癌相關(guān)。
　　另外，本課題還收集了近年P(guān)ubMed上報(bào)導(dǎo)的與前列腺癌

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