應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記分析中國驢品種的遺傳多樣性.pdf

1、該研究以關(guān)中驢、晉南驢、廣靈驢、德州驢和華北驢五個(gè)中國驢品種為研究對(duì)象,利用9個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記分析了品種內(nèi)和品種間的遺傳多樣性.座位AHT5沒有擴(kuò)增,其余8個(gè)座位均表現(xiàn)高度多態(tài).8個(gè)微衛(wèi)星座位的等位基因數(shù)為4~12個(gè),平均為8.6個(gè),期望雜合度在0.869~0.644之間,平均為0.753,多態(tài)信息含量在0.554~0.745之間,平均為0.668.五個(gè)驢品種整體上處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),在8個(gè)微衛(wèi)星座位的平均等位基因數(shù)在

2、5.8~6.5個(gè)之間,平均期望雜合度在0.690~0.755之間.經(jīng)方差分析,五個(gè)驢品種間等位基因數(shù)、期望雜合度和多態(tài)信息含量無顯著差異.五個(gè)驢品種兩兩之間均顯著分化,總體上,在總變異中有5.3％屬于品種間的變異.經(jīng)Friedman檢驗(yàn),群體間分化程度的三種估計(jì)量θ(Weir和Cockerham,1984)、G<,ST>(Nei,1973)和ρ<, ST>(Rousset,1996)之間無顯著差異.以遺傳距離D<,A>(Nei,1983

3、)、D<,AS>(Chakraborty,1993)、D<,R>(Reynolds,1983)、D<,SW>(Shriver,1983)、(δ<,μ>)<'2>(Goldstein,1995)構(gòu)建NJ、UPGMA一致樹,結(jié)果表明:由遺傳距離D<,A>、D<,AS>構(gòu)建的NJ、UPGMA一致樹及由遺傳距離D<,R>、D<、(δ<,μ>)<'2>構(gòu)建的NJ一致樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)完全一樣.由D<,SW>、(δ<,μ>)<'2>構(gòu)建的UPGM

4、A一致樹相同,由DR構(gòu)建的UPGMA一致樹和前兩類樹均不同.D<,SW>、(δ<,μ>)<'2>的一致樹的自展置信值和DA、DAS、DR一致樹的自展置信值相當(dāng).五個(gè)驢品種間的遺傳關(guān)系和前人研究有所不同,有待于基于較多微衛(wèi)星座位和品種歷史的進(jìn)一步研究.以遺傳距離Ds和(δ<,μ>)<'2>,每世代每座位的突變率為10<'-4>,驢的世代間隔為3.5年,估計(jì)了五個(gè)驢品種間的分化時(shí)間.結(jié)果表明:以Ds估計(jì)的五個(gè)品種的分化時(shí)間在公元前1724~