擬南芥和水稻錨蛋白（ANKP）基因家族初步研究.pdf

1、錨蛋白是一類十分重要的結(jié)聯(lián)蛋白家族，其結(jié)構(gòu)的主要特征是含有數(shù)量不一的錨定重復(fù)序列模體，主要作用是介導(dǎo)蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用，廣泛參與細(xì)胞生命活動(dòng)的調(diào)節(jié)。本論文在擬南芥和水稻基因組測序工作完成的基礎(chǔ)上，利用生物信息學(xué)的方法，鑒定和分析了兩種模式植物基因組的錨定蛋白基因。研究結(jié)果如下： 1.鑒定得到108個(gè)擬南芥基因組錨定蛋白基因，并根據(jù)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析，將它們進(jìn)行聚類分析，共分成3個(gè)大組10個(gè)小組。擬南芥基因芯片數(shù)據(jù)庫的查詢和

2、分析，得到一些植物特有的錨定蛋白基因，主要表現(xiàn)在對(duì)植物病原體、逆境、光節(jié)律以及蛋白質(zhì)合成等方面，但它們的功能需要實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步確定。 2.基于基因芯片的分析結(jié)果，選擇10個(gè)擬抗病相關(guān)基因，在轉(zhuǎn)錄水平上初步研究了擬南芥擬抗性基因受植物病原體誘導(dǎo)后的表達(dá)情況，發(fā)現(xiàn)Atlg10340對(duì)鐮刀菌(Fusariumoxysporum)敏感，在其侵染后的第2天出現(xiàn)表達(dá)高峰。 3.克隆和初步分析了擬南芥基因Atlg10340，基因表達(dá)模式分

3、析表明Atlg10340在除角果外均有表達(dá)，亞細(xì)胞定位分析發(fā)現(xiàn)Atlg10340定位于質(zhì)膜上。 4.鑒定得到142個(gè)水稻基因組錨蛋白基因，并根據(jù)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析，將它們進(jìn)行聚類分析，共分成3個(gè)大組14個(gè)小組。并用RT-PCR的方法分析了水稻錨定膜蛋白基因ANKTM的表達(dá)模式。 5.比較和分析了擬南芥和水稻基因組的錨蛋白基因。首先，跟動(dòng)物或其它生物比較，有些錨蛋白基因在各生物體比較保守，這些保守基因可能存在于所有生物中，