18583.卡律蝎毒素(chtx)結構和性質的從頭算和abeemσπ的研究

1、分類號：密級：學校代碼：學號：遣掌研耗大學10165201211000934碩士學位論文卡律蝎毒素(ChTX)結構和性質的從頭算和ABEEM硎勺研究作者姓名：學科、專業(yè)：研究方向：導師姓名：曹軍物理化學理論與計算化學趙東霞教授20l5年4月遼寧師范大學碩士學位論文摘要肽攔截體與離子通道之間進行的分子識別是包含了許多反應的復雜過程。本文選取卡律蝎毒(ChTX)蛋白和6個突變體及其活性區(qū)域氨基酸殘基以及一些類似殘基側鏈的小分子體系作為模型分

2、子，并對這些模型分子進行活性指標的理論研究?？尚?ChTX)蛋白和6個突變體及其活性區(qū)域氨基酸殘基體系均采用實驗結構，類似殘基側鏈的小分子采用B3LYP／63llG(d，p)方法，在Gaussian09程序中優(yōu)化所獲得的結構。使用線性回歸和最小二乘法，擬合了這些模型分子中所涉及的ABEEMtrlt參數(shù)(價態(tài)電負性和價態(tài)硬度)。采用我們所調試的的參數(shù)，ABEEMtrzD亨法所算得的這些體系的電荷分布與HF／STO3G從頭算方法所計算的

3、Mulliken電荷分布的線性方程的斜率接近107，截距接近于0001，線性相關系數(shù)在096以上。表明ABEEMcr；r蔓j“法與從頭算方法所計算的電荷結果具有很好的一致性，驗證了我們所擬合的ABEEMtrn參數(shù)是合理的和可轉移的，可應用于類似體系的電荷分布的計算。采用量子化學方法和ABEEMtrz))法計算了ChTX和6個突變體蛋白質模型分子的整體軟度和整體親電性。利用Hammett關系式，計算有關整體軟度和整體親電性的Hammett

4、系數(shù)，探討了該系數(shù)與卡律蝎毒素與鉀離子通道間的解離常數(shù)鋤的關系。獲得了ChTX以及它的6個突變體對鉀離子通道吸引力的定性描述：整體軟度與ChTX的靜電吸引能力有一定聯(lián)系，ChTX和6個突變體蛋白質的整體軟度越大，蛋白質與鉀離子通道問的解離常數(shù)越小；野生型毒素的整體軟度最大其對應的解離常數(shù)最小，說明在鉀離子通道與ChTX的識別過程中，野生型毒素特有氨基酸對解離常數(shù)七哆的影響很大。應用ABEEMtrot)If法能夠計算出卡律蝎毒(ChTX)