大頭鱈（Gadus macrocephalus）分子系統(tǒng)地理學(xué)研究.pdf

1、大頭鱈(Gadus macrocephalus Tilesius)屬鱈形目(Gabiformes)、鱈科(Gadidae)、鱈屬(Gadus)。大頭鱈分布于北加州至日本，俄羅斯至美國(guó)東北部等北太平洋地區(qū)，我國(guó)黃海是其分布最靠南的海區(qū)。大頭鱈是我國(guó)乃至世界重要的經(jīng)濟(jì)魚類，但是近年來(lái)其資源已嚴(yán)重衰退。大頭鱈作為世界性重要的經(jīng)濟(jì)魚類，國(guó)內(nèi)外對(duì)其研究報(bào)道較少，目前尚無(wú)關(guān)于其分子系統(tǒng)地理學(xué)的研究發(fā)表。 本研究利用線粒體DNA序列分析，結(jié)合

2、RAPD分析從線粒體DNA、基因組DNA等不同層次上開展大頭鱈的分子系統(tǒng)地理學(xué)研究。揭示了大頭鱈的群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性，探討了群體遺傳變異的空間分布格局、群體進(jìn)化歷史，以及第四紀(jì)古氣候變化對(duì)大頭鱈的影響。 (一)線粒體DNA控制區(qū)D-loop序列分析：采集北太平洋10個(gè)群體，共252個(gè)大頭鱈標(biāo)本，經(jīng)PCR擴(kuò)增、測(cè)序，得長(zhǎng)度為456bp的控制區(qū)D-loop片段的核苷酸序列。在所分析的目的片段中共檢測(cè)到68個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，定義了75

3、種單倍型。各個(gè)群體具有較高的單倍型多態(tài)度(h)，較低的核苷酸多態(tài)度(л)。AMOVA分析沒(méi)有檢測(cè)到顯著的群體間遺傳分化。根據(jù)TrN進(jìn)化模型構(gòu)建的大頭鱈控制區(qū)D-loop序列鄰接關(guān)系樹沒(méi)有檢測(cè)到與采樣地點(diǎn)對(duì)應(yīng)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)存在。采用中介網(wǎng)絡(luò)法構(gòu)建了單倍型網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖提示大頭鱈經(jīng)歷了近期的群體擴(kuò)張事件。 (二)隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)DNA(RAPD)分析：從上海生工S系列(S81-S100，S361-S380)40個(gè)隨機(jī)引物中篩選出13個(gè)擴(kuò)增條帶清