中藥方劑桃仁紅花煎的計算藥理學(xué)研究.pdf

1、桃仁紅花煎，是中藥典籍《素庵醫(yī)案》中記載的一則經(jīng)典方劑，由桃仁﹑紅花﹑當(dāng)歸﹑香附﹑延胡索﹑赤芍﹑川芎﹑丹參﹑青皮﹑生地黃十味藥物組成。臨床研究表明其對心血管疾病有較好的治療作用，然而其具體的藥理學(xué)研究很少。中藥方劑的藥理學(xué)研究對于中藥現(xiàn)代化十分重要。如何從中草藥化合物中篩選出相關(guān)靶標的潛在活性化合物是一個非常重要的研究課題，能否從分子水平闡述中藥治療相關(guān)疾病的作用機制也是一個研究熱點。
　　本文主要利用計算機輔助藥物設(shè)計的方法對桃

2、仁紅花煎進行了研究，包括以下三部分：
　　第一，通過查閱文獻得到桃仁紅花煎中的672種化合物小分子，計算其化學(xué)描述符，并對描述符進行分析。然后通過主成分分析研究，并與112個治療心血管疾病的藥物/類藥分子比較。我們利用主成分分析的方法將兩類分子的化學(xué)空間映射到二維和三維空間，進行化學(xué)空間分析。
　　第二，基于分子對接的虛擬篩選。首先，利用分子對接方法將672個桃仁紅花煎中含有的小分子與29種與心血管疾病有關(guān)的蛋白質(zhì)靶標（47

3、個結(jié)合位點）對接打分，篩選得分較高的活性分子。其次，構(gòu)建了小分子-蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)圖，并計算Degree和Betweeness值，根據(jù)Degree的值篩選出了15種活性成分，其中有11種分子被報道具有抗氧化﹑抗炎等生理活性。
　　第三，精細對接。以上篩選出的15種小分子中的9個分子與部分靶標利用軟件AutoDock對做進一步對接，通過研究分子與靶標間的結(jié)合作用及相關(guān)對接數(shù)據(jù)，印證虛擬篩選結(jié)果的正確性，從分子水平上闡述了桃仁紅花煎治療心血