人類miRNA調控因子及靶基因的基因本體分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、MicroRNA(miRNA)是一類約22nt的內源性小分子RNA,主要通過與其靶基因mRNA的3’UTR區(qū)互補結合使之降解或影響mRNA的翻譯,實現(xiàn)了對基因的轉錄后沉默[1]。miRNA通過作用于多個靶基因在很多信號通路,如發(fā)育、分化、增殖、細胞凋亡中發(fā)揮重要作用[2]。同時,其自身表達還受到前體轉錄因子的調控,在人類正常組織和腫瘤細胞系中均存在組織特異性的表達模式[3-4]。從而組成miRNA上下游,復雜調控網(wǎng)絡回路。
　　

2、 本研究利用基因本體(Gene Ontology,GO)數(shù)據(jù)庫[5]和GOmir工具[6],分別對382個miRNA的上游轉錄因子和下游靶基因參與的生物學過程,行使分子功能和細胞組分構成三個方面做聚類分析。分析結果顯示,miRNA的“轉錄因子/轉錄因子”和“靶基因/靶基因”之間,存在著廣泛的正、負相關關系,提示它們之間可能存在協(xié)同或拮抗作用。特別地,我們還發(fā)現(xiàn)一類“轉錄因子/靶基因”之間的相關性,提示轉錄因子可能通過miRNA,影響相關

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