植物miRNA-168a跨界調控人基因表達再分析.pdf

1、學校代碼：10385分類號：研究生學號：1300403007密級：植物植物miRNAmiRNA168a168a跨界調控人基因表達再分析跨界調控人基因表達再分析AstepfurtheranalysisofcrosskingdomregulationofmiRNA168ainhumancells作者姓名：潘峰潘峰指導教師：許瑞安許瑞安合作教師：PhilippKapranovPhilippKapranov學科：生物學（生物化學與分子生物學）生

2、物學（生物化學與分子生物學）研究方向：MicrNAMicrNA跨界調控跨界調控所在學院：生物生物醫(yī)學學院醫(yī)學學院論文提交日期：二零二零一六年一六年三月二十二十日摘要I摘要植物micrNAs(miRNAs)跨界調控人基因表達現象首次發(fā)現于2011年，植物源性食物中的miRNA168a可經腸胃道進入血液循環(huán)到達肌體各個組織，在哺乳動物肝細胞中靶向抑制低密度脂蛋白銜接蛋白受體1(LDLRAP1)的翻譯表達，從而影響血脂代謝。然而，目前食物中植

3、物源性的miRNAs存在的跨界調控人基因表達現象只發(fā)現了兩個靶點，也只研究了與之對應的兩個植物miRNA。miRNAs跨界調控靶點預測研究的滯后性以及有限的參考文獻是這一研究領域發(fā)展緩慢的重要原因。本研究在概括了miRNA跨物種調控的內容與機制的基礎上系統(tǒng)性分析了現有miRNA靶點預測的計算機學習原則，針對植物miRNA跨界調控人基因表達靶點預測方面的功能與分析限制，本研究歸納了從NCBI現有數據中挖掘miRNA168a跨界調控靶點的研

4、究方法，在南京大學張辰宇教授課題組miRNA168a靶點預測的基礎上新增了近18個非重復性靶點，為后續(xù)研究miRNA跨界調控的科研工作者提供有用借鑒。進一步的數據分析發(fā)現miR168a在人體細胞內具有潛在調控靶點，慢型骨骼肌肌球蛋白結合蛋白C(MYPBC1)，該基因表達的MYBPC1接頭蛋白在運動能量提供中具有重要作用，我們設計了鑲有miRNA168a與MYBPC1的mRNA結合位點的綠色熒光報告基因以及對照實驗，重組熒光質粒與miRN

5、A168a雙轉染DU145細胞后，發(fā)現實驗組綠色熒光強度確實有降低，且后續(xù)A549細胞中的MYBPC1蛋白免疫印記實驗也證明了miRNA168a對MYPBC1具有下調作用，因此，本研究初步確定了miRNA168a對MYBPC1具特異性的有負調控作用；最后，通過CCK8試劑檢測轉染miR168a后對癌細胞SHSY5Y和22RV1增殖的影響，研究發(fā)現處理后的細胞活性具有一定的變化規(guī)律，然而，其內在調控機制有待進一步研究。關鍵詞：miRNA1