基于文昌魚(Branchiostoma floridae)ESTs的轉錄組比較分析及EST數(shù)據(jù)庫構建.pdf_第1頁
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1、r1106474分類號密數(shù)單位代碼:1Q3笪學號:SQ4Q21Q!122名微虐業(yè)太虧學位論文基于文昌魚(Branchiostomafloridae)ESTs的轉錄組比較分析及EST數(shù)據(jù)庫構建Transcriptome—wideComparativeAnalysesbasedonAmphioxus(Branchiostomafloridae)ESTsandItsESTDatabase研究指導教師:王苤宣教援合作指導教師:呈]數(shù)援專業(yè)領域名

2、稱:生塑塑理研究方向:生塹信。墾堂答辯委員會主席:2007年6月6在特定C、P、F功能的不同發(fā)育階段,其階段持續(xù)性表達水平大小依次為C、F、P,而階段特異性表達水平大小則為F、P、C,但在成體期其表達水平為C、F、P表達量依次增高。進一步分析發(fā)現(xiàn):在與細胞組件相關的功能特異性表達方面,幼體期的特異性表達量最高;在與分子功能活性相關的功能特異性表達中,神經胚時期的特異性表達量最高;面參與生物過程的功能特異性表達方面,神經胚時期的特異性表達

3、量則最高。7不同物種間轉錄組分析顯示尾索動物海鞘的轉錄組與棘皮動物海膽的最接近,其相關系數(shù)為O896,而海膽與文昌魚的相關系數(shù)只有O682,結果表明在進化上文昌魚可能與脊椎動物更接近。8運用Apache、php、MysQL技術搭建了Widows平臺的文昌魚EST分析數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫中收錄了原始的277538條EST數(shù)據(jù),收錄了文昌魚轉錄層次各方面的數(shù)據(jù)和結果(http://amphioxustrmueducn/homepagephp)。上

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