基于葉綠體序列rpl16的中國櫻桃居群遺傳多樣性及居群遺傳結構研究.pdf

1、中國櫻桃（Cerasus pseudocerasus Lindl.）是起源于我國的落葉果樹，它隸屬于薔薇科(Rosaceae)李亞科(Prunoideae)櫻屬（Cerasus），約有3000余年的栽培歷史，其早熟性、觀賞性賦予了它很高的經濟價值。中國櫻桃在我國有著廣闊的分布，在川、云、陜、貴分布著其豐富的野生資源，河南、安徽、四川、貴州、甘肅、重慶等省市分布著中國櫻桃的重要栽培種質，但是目前關于中國櫻桃野生及栽培資源的遺傳背景還了解得

2、不夠全面、深入，影響了對中國櫻桃優(yōu)良種質的保護和利用。鑒于此，本文采集了來自四川、安徽、河南、陜西、貴州、重慶等省市的263份中國櫻桃材料，包括9個中國櫻桃野生群體和8個中國櫻桃栽培群體，基于葉綠體序列rpl16內含子區(qū)，展開了對中國櫻桃資源的遺傳多樣性評價和居群遺傳結構分析，其結果如下:
　　1.中國櫻桃資源遺傳多樣性評價。17個群體的263個體的葉綠體片段序列遺傳多樣性研究結果表明:1)263條rpl16內含子區(qū)序列共檢測到1

3、4個多態(tài)性位點，所有17個群體共檢測到22個葉綠體單倍型。單倍型多態(tài)性(Hd)分布范圍為0.000-0.879，總群體的單倍型多態(tài)性(Hd)為0.689。核苷酸多樣性（π）分布范圍為0.00000-0.00316，，總群體的核苷酸多樣性(π)為0.00184。2）不同群體類型之間的遺傳多樣性水平相差較大，其中野生群體擁有較高的遺傳多樣性水平，其平均單倍型多樣性Hd=0.776，核苷酸多樣性π=0.00258，而栽培群體的平均單倍型多樣性

4、水平Hd=0.575，核苷酸多樣性π=0.00076。中國櫻桃桃具有豐富的遺傳多樣性，這一結果與大多數研究結果是一致的，而栽培群體較低水平的遺傳多樣性形成的原因可能是由于長期的馴化栽培及無性繁殖引起的嚴重的瓶頸效應使得其有效群體大小嚴重減小所導致的。
　　2.中國櫻桃的群體遺傳結構。群體遺傳結構研究結果表明:1）兩兩群體間遺傳分化結果顯示:17個中國櫻桃群體兩兩群體間的遺傳分化系數Fst的變化范圍為0.0000～0.8912，除野

5、生貴陽群體、野生青川群體、野生商南群體與各栽培群體間的遺傳分化系數較大，其余群體間遺傳分化系數相對較小，兩兩群體間遺傳分化不明顯;野生群體與栽培群體間的遺傳分化系數Fst=0.1558(P=0.0000)，雖然少數幾個野生群體與栽培群體間有較為明顯的遺傳分化，但在總體上看野生群體與栽培群體之間的遺傳分化并不明顯。2）分子差異分析(AMOVA)結果表明:中國櫻桃總群體與栽培群體的遺傳變異主要來源于群體內，而栽培群體的遺傳變異有65.57％

6、來源于群體間，34.43％來源于群體內。3）基于K-2P模型的遺傳距離結果顯示，17個群體兩兩之間的遺傳距離變化范圍為0.000～0.004，野生商南群體與其余群體的遺傳距離最遠?；贙-2P模型遺傳距離的聚類分析中17個中國櫻桃群體主要被聚為兩個大支，野生青川群體與野生商南群體被聚為一支(Ⅱ)，其余群體被聚為另一支(Ⅰ)，說明野生青川群體與野生商南群體與其余群體遺傳距離較遠。單倍型的NJ聚類圖與單倍型的網絡圖是單倍型關系結果的拓撲結構

7、，表明:22個單倍型分為了兩個大的分支A和B，A、B分枝分別包含了13和9個單倍型，大分枝A分為了A1和A2兩個亞枝，大分枝B分為了B1和B2兩個亞支。單倍型Hap1與Hap2是分布最廣的兩個單倍型，且有較高的頻率。4）中性檢驗與錯配分析結果顯示:栽培群體的Tajiama's D為顯著的負值，且其錯配分布曲線是一個峰曲線，說明栽培群體是一個不穩(wěn)定群體，其偏離了中性進化，近期經歷過大規(guī)模的群體擴張。由以上研究結果推知:中國櫻桃的繁育系統(tǒng)與