基于序列多態(tài)研究山東野生丹參居群的遺傳多樣性.pdf

1、自然界中,物種的多樣性和進化潛力是其自身生存和發(fā)展的基礎,保護物種以及物種所蘊藏的遺傳多樣性就是保護生物多樣性。豐富的遺傳多樣性是物種適應外界環(huán)境變化的物質基礎,種內遺傳多樣性或變異性越豐富,物種適應環(huán)境變化的能力就越大。通過對物種遺傳多樣性和遺傳結構的研究可以了解該物種種內遺傳變異的大小、時空分布及其與環(huán)境的關系,以便采取科學有效的措施來保護人類賴以生存和發(fā)展的遺傳資源。
　　 丹參(Salvia miltiorrhiza B

2、unge)隸屬于鼠尾草屬(Salvia)、唇形科(Labiatae),屬多年生草本植物,其干燥根及根莖入藥,是一種傳統的中藥,具有活血化瘀、止痛、鎮(zhèn)靜安神等功效。20世紀70年代中期,隨著野生丹參資源的不斷減少,丹參已經供不應求,在全國許多地區(qū)都開始栽培,目前栽培品已成為丹參的主要來源。作為丹參的主產區(qū)之一,山東丹參的資源較為豐富,但是隨著丹參經濟價值的不斷提升和人們缺乏對生物資源保護和可持續(xù)利用的意識,當地居民無節(jié)制的采挖現象日益嚴重

3、,使得山東野生丹參資源逐年減少。因此,及時掌握山東丹參資源的遺傳多樣性,將為迫在眉睫的丹參種質資源保護、引種馴化、遺傳改良和優(yōu)良品種選育提供理論依據。
　　 高等植物中,葉綠體DNA具有高度保守的編碼區(qū)和相對多變的非編碼區(qū),葉綠體DNA在一些非編碼區(qū)域存在相對較高的核苷酸置換率,從而使之在種間和種內都擁有較高的遺傳變異,這一遺傳特點使其成為植物系統學和居群遺傳學研究的首選片段。葉綠體psbA-trnH基因間隔區(qū)是位于葉綠體DNA

4、基因組上psbA和trnH基因之間的一段平均長約450bp的非編碼序列,由于該片段中普遍存在插入／缺失事件從而導致了不同植物間片段長度變異較大,片段兩端存在75bp的保守序列,便于設計通用引物,可用于植物屬間及種間的系統發(fā)育研究
　　 本研究依據葉綠體psbA-trnH基因間隔區(qū)的序列多態(tài)對來自山東地區(qū)丹參的3個自然居群和一個栽培居群進行了遺傳結構研究。結果顯示,80個供試材料中共有10種單倍型,核苷酸多樣性為0.024,葉綠體

5、DNA單倍型進化分支分析把10種單倍型分為2大支,但每支都由4個居群的單倍型共同構成；Nei多樣性指數為0.284,Shannon信息指數為0.406,多態(tài)位點百分比率為70％；4個居群總基因多樣性為0.905,居群內平均基因多樣性指數為0.747,遺傳分化系數為0.175；不同居群間的遺傳分化系數為0.017～0.199,基因流為2.013～28.912；AMOVA分析揭示居群間只有5％的遺傳差異。研究結果表明山東丹參遺傳多樣性水平較