血管內皮細胞中NF-κB靶基因的鑒定.pdf

1、核因子κB(NF-κB)是一類與炎癥和腫瘤相關的重要轉錄因子，普遍存在于體內各種類型的細胞內。當受到外界刺激時NF-κB會被激活，從而調節(jié)下游基因的表達，影響細胞的生長、凋亡、免疫與癌變等過程。血管病變被認為是一種炎癥反應，與NF-κB信號通路有密切關系，研究認為NF-κB的激活是動脈粥樣硬化等心血管疾病發(fā)生發(fā)展的始動機制之一，因此研究NF-κB與心血管疾病的關系有很重要的意義。
　　本論文以血管內皮細胞作為研究對象，分別用TNF

2、α誘導及p65 siRNA干擾處理，用基因芯片技術對轉錄因子NF-κB在血管內皮細胞的靶基因和靶miRNA進行了鑒定，主要研究結果如下:
　　1.采用基因芯片技術檢測TNFα誘導及p65 siRNA干擾的主動脈內皮細胞的基因表達譜。對樣品進行初步的qPCR檢測后得到處理成功的樣品，之后進行基因表達譜檢測。篩選得到基因表達變化倍數(shù)大于1.5倍的61個上調和49個下調的NF-κB靶基因，對NF-κB靶基因與相關疾病進行分析，發(fā)現(xiàn)9個靶

3、基因與4種血管相關疾病關系密切?；虮倔w論(Gene Ontology，GO)分析發(fā)現(xiàn)，這些靶基因與炎癥、免疫、代謝、刺激應答和器官發(fā)育等生物過程有關。此外，KEGG分析發(fā)現(xiàn)，T細胞受體(T cell receptor，TCR)和類Toll受體(Toll-like receptors，TLR)通路的活化也可以進一步激活NF-κB信號通路，一個基因可同時在幾個通路發(fā)揮作用。
　　2.采用基因芯片技術對TNFα和p65 siRNA處理

4、后主動脈內皮細胞中NF-κB的靶miRNA進行鑒定。篩選后得到表達變化倍數(shù)大于1.5倍的23個上調和6個下調的NF-κB的靶miRNA，對這些NF-κB靶miRNA與相關疾病進行分析，發(fā)現(xiàn)10個miRNA與4種血管相關疾病關系密切。綜合近年研究與本論文表達譜結果，得到NF-κB與miR-199a、miR-10a和miR-15的3個調控回路關系。對miRNA進行靶基因預測后與第一部分得到的NF-κB靶基因比較取交集，共有40個NF-κB靶

5、miRNA的靶基因。GO分析表明這些靶基因多涉及調控、免疫、生物粘附及細胞分化等生物過程。分析NF-κB靶miRNA與靶基因的相互調控關系，有15個miRNA參與負調控，21個miRNA參與正調控。其中過表達的miR-339-5p可能調控著Cadm4的下調;Wisp1受到miR-339-5p、miR-10a、miR-107、miR-15b、miR-93和miR-762等幾個miRNA的負調控。Dkk2和Syne1受到miR-10a的正調