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文檔簡介
1、肝臟有重要的生理功能和很強的再生能力。在物理、化學、生物等因素誘導下,殘肝細胞進行增生以補償丟失的肝組織和恢復肝臟的生物學功能,此過程稱為肝再生(liver regeneration,LR)。研究表明,肝再生涉及細胞激活、去分化、細胞增殖及調控、再分化、組織結構和功能重建等生理活動,以及組織和細胞形態(tài)、結構的一系列變化。另一方面,核因子κB(nuclear factorκB,NF-κB)信號通路參與調節(jié)免疫反應、炎癥反應、細胞增殖、細胞
2、發(fā)育等重要生理活動相關基因的轉錄。為了從基因組轉錄水平了解其在大鼠肝再生中對肝細胞增殖的調控作用。本文用大鼠全基因組表達譜芯片RatGenome2302.O檢測NF-κB信號通路、細胞增殖、NF-κB信號通路調節(jié)的細胞增殖相關基因,用RT-PCR確證芯片檢測結果的可靠性。研究表明,NF-κB信號通路、細胞增殖和NF-κB信號通路調節(jié)的細胞增殖活動分別包含238、1680和121個基因,Rat Genome2302.0芯片含其中的197、
3、1314和118個,大鼠再生肝中的有意義表達基因個數(shù)分別是79、423和56,肝細胞中的有意義表達基因數(shù)分別是83、484和58個。另外,用BLAST軟件分析Affymetrix芯片上未知的肝再生相關基因同源性發(fā)現(xiàn),大鼠再生肝中NF-κB信號通路、細胞增殖、NF-κB信號通路調節(jié)的細胞增殖相關基因的同源新基因分別有19、86和6個。肝細胞中的同源新基因分別有21、104和11個。然后,用譜函數(shù)(Et)計算相關基因的表達變化及它們預示的細
4、胞增殖活動表叫,在大鼠再生肝中,途徑1、12和13在大鼠肝再生起始和進展階段以及途徑5和6在進展階段的信號傳導活動增強;細胞增殖和NF-κB信號通路調節(jié)的細胞增殖相關活動亦在起始和進展階段增強,并與信號傳導活動正相關。在肝細胞中,途徑1在起始和進展階段、途徑12在整個大鼠肝再生、途徑13在進展和終止階段的信號傳導活動增強;而肝細胞增殖和NF-κB信號通路調節(jié)的肝細胞增殖活動在整個肝再生中都顯著性地增強,且同樣與其信號傳導活動呈現(xiàn)正相關。
5、最后,本文又用T檢驗(T-Statistic)方法挖掘關鍵基因和Pathway Studio7.0軟件分析其關鍵基因的作用機理表明,在大鼠再生肝中,途徑1通過關鍵基因Tnfrsf12a、途徑5和6通過關鍵基因Lbp、途徑12通過起關鍵作用的Rras2的同源基因AI548708和途徑13通過關鍵基因Cxcl16、Fgr、Cxcr4增強NF-κB活性,提高關鍵基因Jun、Myc、Ldha、Bc13和其他相關基因的表達,促進細胞增殖。在肝細胞
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