獼猴MHC-DPB1基因外顯子2多態(tài)性研究.pdf

1、不同種群的獼猴(Macaca mulatta) MHC基因的差異性，很大程度上影響了用其作為動物模型的實驗研究結(jié)果的穩(wěn)定性、可靠性和可重復性。因此清晰的了解獼猴免疫遺傳學背景，對于運用該種群開展各項研究是非常重要的，將為它們在生物醫(yī)學研究中的應用及其遺傳資源的保護提供重要的科學依據(jù)。本文以四川獼猴的7個群體為研究對象，采用變性梯度凝膠電泳(Denaturing gradient gel electrophoresis，DGGE)和克隆測

2、序技術(shù)分析了217個四川野生獼猴MHC-DPB1位點的exon2的多態(tài)性，獲得如下結(jié)果：
　　 1)共檢測到59個Mamu-DPB1等位基因，其中有52個為本研究中首次發(fā)現(xiàn)的新等位基因；從整個大獼猴群體（217個個體）來看，等位基因頻率最高的是Mamu-DPB1*04(0.068)；單獨從不同地理群體來看，最高等位基因頻率分別為：小金-DPB1*30(0.081)，黑水-DPB1*04(0.103)，巴中-DPB1*32(0.1

3、07)，漢源-DPB1*23(0.071)，九龍-DPB1*04(0.81)，丹巴-DPB1*04(0.071)，北川-DPB1*04(0.107)；
　　 2)獼猴與食蟹猴MHC-DPB1外顯子2氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn)，在其中的51個位點，鑒定出67個物種特異性的氨基酸殘基。這些殘基中，有39個為Mamu-DPB1等位基因特異的氨基酸殘基，其中有33個位于新發(fā)現(xiàn)的52個Mamu-DPB1等位基因序列中；
　　 3)不同物種

4、來源的DPB1等位基因系統(tǒng)發(fā)生樹(N-J)研究發(fā)現(xiàn)，獼猴和其近緣物種食蟹猴(Macaca fascicularis)的DPB1等位基因間存在跨種多態(tài)(Trans-speciespolymorphism)現(xiàn)象，表明新的等位基因的出現(xiàn)可能是相同或近似自然選擇壓力下趨同進化( convergent evolution)的結(jié)果；
　　 4)Nei-Gojibori-p計算出來單個群體平均距離由大到小為：漢源＞小金＞九龍＞北川＞丹巴＞黑水

5、＞巴中，這反映由氨基酸差異造成的平均遺傳距離漢源最高，巴中最低。由Kimura-2-parameters計算出來各個群體平均遺傳距離由大到小為：漢源＞小金＞巴中＞北川＞九龍＞黑水＞丹巴，這反映出各群體內(nèi)部遺傳多樣性漢源最高，丹巴最低。
　　 以上結(jié)果表明，獼猴MHC-DPB1基因外顯子2區(qū)域具有較高的多態(tài)性，且MHC-DPB1基因在中國獼猴群體和以前作為主要研究對象的印度獼猴群體間具有較大的差異。因此，深入分析各地理分布群之間M